这是一个魔法少女的存在已经被认可的世界。一款名为“魔法少女育种计划”的游戏可以创造出一个真正的魔法少女,等待这些幸运少女的将是万千人的仰慕和一个美好的未来。然而有一天,运营商突然宣布将魔法少女的数量削减一半,方法竟然是让现有的魔法少女进行一场残酷的竞争。天真善良的少女白雪(东山奈央配音)、外冷内热的忍者波(沼仓爱美配音)、手持巨剑的圣女(佐仓绫子配音)、骑着扫帚粗心大意的最高速度(内山夕实配音)、杀死艾玛的神枪手(井上喜久子配音),在这些由吉祥物费伯挑选出来的魔法少女(宫古山核桃配音)中,一场大战随即展开。